Asas, Dasar dan Paham

• IAINU Kebumen berasaskan Pancasila;
• Berdasarkan UUD 1945, NKRI dan Bhinneka Tunggal Ika;
• Berpaham Islam ahlussunah waljamaah annahdliyah.

Pola Ilmiah Pokok

• Pola ilmiah pokok adalah panduan pola pikir dan pola laku ilmiah civitas akademika dalam mencapai visi dan misinya berupa arah kebijakan dan strategi pengembangan yang dimanifestasikan dalam seluruh pengembangan sehingga menjadikan ciri khas keunggulan (distinction) IAINU Kebumen;
• Paradigma pola ilmiah pokok IAINU Kebumen mengembangkan keilmuan Islamic Studies yang moderasi dan inklusi dengan berpedoman pada kaidah al-mukhafadlatu ‘ala al-qodimi al-solih wa-al ahdzu bi al-jadidi al-aslah;
• Core value pola ilmiah pokok mengembangkan nilai-nilai obyektivitas, ilmiah, kebenaran, keadilan, nirlaba, otonomi, transparansi, akuntabilitas, quality assurance, dan kemaslahatan.