IAINU Kebumen memberikan peluang kepada masyarakat untuk mendapatkan akses beragam beasiswa diantaranya:

1. Beasiswa Kartu Indonesia Pintar (KIP)
2. Beasiswa Yayasan Penyelenggara Pendidikan Nahdlatul Ulama (YPPNU) Kebumen
3. Beasiswa BAZNAS
4. Beasiswa Tahfidz
5. Beasiswa Prestasi
6. Beasiswa Penelitian BRIN